В мультфильме «Мегамозг против Синдиката рока» бывший суперзлодей Мегамозг старается зарекомендовать себя в новой роли супергероя, пытаясь искупить свои прошлые ошибки. Его спокойствие нарушает возвращение Синдиката рока — старой банды мятежных приспешников, стремящихся к власти в Метро-Сити. Перед Мегамозгом встает непростой выбор: примкнуть к злу или использовать свои таланты, чтобы противостоять бывшим союзникам. Объединившись с новыми друзьями, он разрабатывает хитроумный план, чтобы остановить зло, одновременно открывая для себя, что настоящий героизм заключается не только в силе, но и в верности своим принципам. Мегамозг готов на всё ради защиты своего города!